เคมีอาหาร (food chemistry) มีความสำคัญอย่างมากในการเปลี่ยนแปลงทางเคมีของอาหารระหว่างการเก็บเกี่ยว การแปรรูป และการเก็บรักษา รวมทั้งบทบาทของสารเคมีในกระบวนการแปรรูปอาหาร อีกทั้งยังเป็นส่วนประกอบสำคัญในการผลิตอาหารสำเร็จรูปต่างๆ อาหารทางการแพทย์ หรือแม้กระทั่งเครื่องดื่มต่างๆ อีกด้วย